Au niveau national :

La Fédération dispose d'un Service d'Information Produits (SIP), cellule de veille dans les domaines de la sécurité et de la qualité alimentaire et non alimentaire, de la santé, de la nutrition, et de l'environnement.

Elle organise régulièrement, avec l'aide du SIP, des réunions et des séminaires scientifiques et a édité deux modules de formation et de sensibilisation sur l'hygiène et la nutrition.
Elle a rédigé deux référentiels d'audit de la chaîne du froid, ainsi que sept guides des bonnes pratiques d'hygiène pour les ateliers et les rayons "à la coupe", dont cinq ont été validés par les pouvoirs publics (guides parus aux éditions du Journal Officiel).

Elle a formalisé et mis en place les procédures d'alerte et de crise, ainsi que deux réseaux d'alertes (pour les produits alimentaires et pour les produits non alimentaires).
FCD est partenaire des différentes directions ministérielles responsables de la qualité et la sécurité des aliments, de la consommation et de la santé des consommateurs, ainsi que du Programme National Nutrition Santé (PNNS) et est l'interlocuteur de l'Agence Française de la Sécurité Sanitaire des Aliments (AFSSA).

Elle est membre de toutes les instances officielles dans le domaine alimentaire (Conseil National de la Consommation - CNC, Conseil National de l'Alimentation - CNA, INAO, Commission Nationale des Labels et des Certifications - CNLC, etc.).

Au niveau international :

- Afin de créer un socle d'évaluation commun et mutuellement reconnu des exigences en terme de sécurité alimentaire des produits transformés à marque de distributeur (MDD), la FCD et ses adhérents ont rejoint en 2003 l'initiative des distributeurs allemands réunis au sein de la fédération HDE pour mettre en place le référentiel et le dispositif d'audit appelé International Food Standard ou IFS.